Kljub temu da je sodobna 3D tehnologija postala izjemno zanesljiva in uporabniku prijazna, skoraj vsak lahko zasnuje svoj model, pa za nemoteno delovanje še vedno zahteva redno vzdrževanje. Med najpomembnejša opravila sodita čiščenje tiskalne površine pred vsakim zagonom in občasno preverjanje izravnanosti delovne mize(nekateri printerji to zdaj delajo že avtomatsko). Z ustreznim vzdrževanjem namreč preprečimo slabo prijemanje prvega sloja, ki je najpogostejši vzrok za neuspešno tiskanje. Kljub skrbni pripravi pa lahko med samim postopkom kljub temu pride do nepredvidenih zapletov ali napak. Druga najpogostejša težava je zamašitev tiskalne šobe, do česar pride zaradi nečistoč v filamentu ali nepravilnih temperaturnih nastavitev segrevanja. V takšnih primerih je treba šobo temeljito očistiti ali jo po potrebi zamenjati, da lahko tiskalnik ponovno nemoteno nadaljuje z delom.
